हड़प्पा से उत्खनित अवशेषों में इतिहासकारों ने प्रायः एक त्रिमुखी आकृति को “त्रिमुखी पशुपतिदेव” के रूप में पहचाना है। किंतु पारंपरिक शास्त्रों का सूक्ष्म अध्ययन यह बताता है कि यह त्रिमुखी देवता वास्तव में रुद्रज्वर (या महेश्वरज्वर) हैं, जो भगवान रुद्र के सहायक एवं उनके एक स्वरूप हैं और शारीरिक रोगों एवं व्याधियों पर नियंत्रण रखते हैं।
हड़प्पा अवशेषों में एक-मुखी रुद्र तथा त्रिमुखी आकृतियाँ दोनों मिलती हैं, किंतु लिंग पुराण, शिव पुराण और नमक मंत्र इस विशिष्ट संदर्भ में स्वयं भगवान रुद्र को त्रिमुखी रूप में वर्णित नहीं करते। इसलिए त्रिमुखी स्वरूप को रोगों के नियंत्रक रुद्रज्वर और एक-मुखी स्वरूप को भगवान रुद्र के रूप में पहचानना एक स्वाभाविक और शास्त्रानुकूल व्याख्या के रूप में प्रस्तुत किया गया है।
त्रिमुखी महेश्वरज्वर की पहचान श्रीकृष्ण और बाणासुर के बीच हुए प्रसिद्ध युद्ध में विशेष रूप से सामने आती है, जहाँ भगवान रुद्र बाणासुर के समर्थन में खड़े थे:
महेश्वरज्वर: युद्ध के दौरान महेश्वरज्वर—जिन्हें विशेष रूप से तीन सिर और तीन पैरों वाले रूप में वर्णित किया गया है—को श्रीकृष्ण से युद्ध करने के लिए बुलाया गया।
वैष्णवज्वर: इसके उत्तर में श्रीकृष्ण ने महेश्वरज्वर का प्रतिकार करने के लिए वैष्णवज्वर को प्रकट किया।
शरणागति: महेश्वरज्वर वैष्णवज्वर से पराजित हुए और अंततः श्रीकृष्ण की शरण में जाकर उनके चरणों में आश्रय लिया।
“इस पवित्र कथा का विस्तृत वर्णन हरिवंश तथा श्रीमद्भागवतम् (स्कन्ध 10, अध्याय 63) दोनों में मिलता है।”
[ भक्त की तीव्र उपासना ] ──► [ सारूप्य मुक्ति की प्राप्ति ] ──► [ देवता का रूप एवं शक्ति प्राप्त करता है ] (त्रिमुखी रोग-नियंत्रक) सारूप्य मुक्ति (समान दिव्य स्वरूप की मुक्ति): मुक्ति के चार प्रकारों (सालोक्य, सामीप्य, सारूप्य, सायुज्य) में सारूप्य मुक्ति भक्त को उसके आराध्य देवता के समान दिव्य स्वरूप प्रदान करती है। भगवान रुद्र की तीव्र उपासना के माध्यम से एक उच्च दिव्य सत्ता ने रुद्र के दिव्य गुणों से मिलता-जुलता स्वरूप प्राप्त किया और उसे रोगों के नियंत्रक के रूप में व्याधियों पर अधिकार प्रदान किया गया।
महान्यास में आवाहन: क्योंकि रुद्रज्वर रोग और स्वास्थ्य पर नियंत्रण रखते हैं, महर्षि बौधायन अपने महान्यास खण्ड में यह विशेष रूप से बताते हैं कि जो व्यक्ति रोग से मुक्ति और उत्तम स्वास्थ्य की कामना करता है, उसे महान्यास के पाठ के साथ भगवान रुद्र की आराधना करनी चाहिए।
| पुरातात्त्विक विशेषता | ऐतिहासिक भ्रांति | शास्त्रानुसार सही पहचान |
| त्रिमुखी आकृति | “त्रिमुखी पशुपति शिव” | रुद्रज्वर / महेश्वरज्वर (रोगों के नियंत्रक एवं रुद्र के सहायक) |
| एक-मुखी आकृति | अनिर्दिष्ट / सींगयुक्त देवता | भगवान रुद्र / शिव (जैसा कि नमक एवं पुराणों में वर्णित है) |
इन पुरावशेषों का प्रामाणिक वैदिक और पौराणिक साहित्य के दृष्टिकोण से पुनः अध्ययन लंबे समय से चली आ रही ऐतिहासिक भ्रांतियों को स्पष्ट करता है। त्रिमुखी आकृति को रुद्रज्वर के रूप में समझना वैदिक प्रतिमाशास्त्र, पौराणिक इतिहास और शास्त्रों में संरक्षित उपचार-संबंधी परंपराओं के साथ सुसंगत बताया गया है।